Au coeur du quartier des samouraïs a été édifiée en 1931 une surprenante église catholique de style gothique, au sol en tatamis. Celle-ci rend hommage au missionnaire jésuite saint François-Xavier et aux 36 chrétiens japonais qui furent martyrisés ici en 1868 pour avoir refusé d'abjurer leur foi. À côté de l'église, un petit musée témoigne de l'histoire des chrétiens persécutés durant l'ère Meiji. Chaque année, une grande messe est célébrée le 3 mai en mémoire de la tragédie.