Installé en 1995 dans une belle maison du 17e s. et géré par l'Université nationale de Trujillo, le musée présente dans sept salles un parcours didactique et chronologique à travers les cultures précolombiennes du Nord du Pérou : collections de poteries cupisnique et salinar, maquette du site de Caballo Muerto, important fonds de céramiques mochica jusqu'à la période inca, idoles en bois chimú, provenant de Chan Chan, ainsi que des objets provenant des fouilles des pyramides de Moche, et notamment de la Huaca de la Luna.