La muséographie d'avant-garde du Musée historique guide le visiteur à travers trois époques importantes dans l'histoire de Strasbourg : d'abord la ville libre du Saint Empire romain germanique (1262-1681) grâce aux objets trouvés lors des fouilles archéologiques ; ensuite la ville royale et révolutionnaire (1681-1800), dont la pièce maîtresse du musée, le plan-relief de Strasbourg réalisé par Ladevèze en 1727 ; et enfin la naissance d'une métropole (19e et 20e s.).