Reconstruite à partir de 1396 en remplacement du prieuré de Saint-Flour, l'église, de style gothique, fut achevée au milieu du 15e s. Nef et bas-côtés frappent par la sobriété de leurs lignes. Sous la tribune d'orgue, une peinture murale (15e s.) représente le purgatoire et l'enfer. Admirez, face à la chaire, le grand Christ en bois (12e s.) appelé le « Beau Dieu noir », une pietà du 15e s. dans la chapelle Saint-Jean-Baptiste et, dans la chapelle absidiale, la châsse en bronze doré contenant les reliques de saint Flour.