Le Museum d'Histoire naturelle est entièrement dédié aux amoureux de la nature. Au rez-de-chaussée, un comptoir délivre les informations sur les sentiers balisés de la région. Une grande salle diffuse un film en 4K sur les quatre saisons à Okunikko. Au 1er étage, un 1er circuit présente la géologie des lieux (création de l'immense caldeira par l'éruption du mont Nantai), les différents écosystèmes et la riche faune locale (ours, oiseaux, poissons...). Un 2e circuit retrace l'histoire du développement économique et culturel de l'ex-province de Shimotsuke.