C'est dans le prieuré de l'ancienne chartreuse (1598-1792) que se trouve le musée consacré à l'histoire de Molsheim et de sa région, de la préhistoire à nos jours. Avec l'arrivée des jésuites, des capucins et des chartreux, Molsheim devient au 17e s. la capitale religieuse de l'Alsace. Une partie du cloître a été restaurée, et deux cellules de moines, reconstituées. Dans un autre bâtiment, la Fondation Bugatti présente des souvenirs de la famille et quelques modèles de voitures construites ici entre les deux guerres.