Des milliers de blocs portant pour la plupart de superbes fragments de reliefs sont alignés dans l'attente de retrouver leur place dans divers monuments du site. Certains ont été reconstitués par anastylose, tels l'autel à cornes, la chapelle en calcite de Thoutmosis IV, la chapelle blanche de Sésostris Ier (premier bâtisseur de Karnak) et la chapelle rouge ou sanctuaire de la barque d'Hatchepsout, remontée par des tailleurs de pierre appartenant aux Compagnons de France.