Très vaste, cette église frappe par sa sobriété et l'élan de ses voûtes. Le choeur est agrémenté de vitraux datant de l'époque manuéline (16e s.) et illustrant des scènes de la vie de la Vierge et du Christ. La chapelle du Fondateur, éclairée de fenêtres flamboyantes, abrite les tombeaux du roi Jean Ier et de sa femme Philippa de Lancastre.