Échantillons minéralogiques et blocs de houille conservant l'empreinte de plantes et d'animaux évoquent l'évolution géologique du bassin d'Autun, du Morvan et de la Bourgogne au cours des grandes ères géologiques. Quant à la Bourgogne d'aujourd'hui, elle est évoquée par une belle collection d'oiseaux naturalisés.