Cette mission a été bâtie pour les réfugiés. Reconstruite au 19e s après une inondation, il s'agit d'un exemple architectural remarquable de mission espagnole avec ses poutres sculptées à la main par des Indiens piros. C'est la plus ancienne paroisse en activité des Etats-Unis. Egalement toujours utilisée, la chapelle dorée du Presidio San Elizario est réputée pour son style architectural tardif en adobe. Elle allie des caractéristiques du Sud-Ouest américain à des éléments européens comme les contreforts.